작품창고 프로그램은 훼손되거나 망실되기 쉬운 작품, 보관이 어려운 특수작품, 그리고 다양한 작업방식과 설치규모에 따른 관리의 필요성이 요구되는 작품들을 일정 기간 동안 보관해 주는 프로그램이다. 작품창고는 매해 초에 계약 만료 공간 분에 한 하여 공모하며, 작품창고 임대에 선정된 작가는 계약을 통해 소정의 임대료를 납부하여야 작품창고를 사용할 수 있다. 보통 1년간 계약하고 연장할 수 있다. (임대료 기준표 참고)
동시대 작가들 중에서 환경변화에 민감하지 않은 설치 형 예술작업이나 대형 설치 물을 해체 및 포장하여 보관하기 위하여 공간사용이 필요한 작가들을 대상으로 창고를 상시 임대하여 운영한다. 그리고, 경기창작센터가 주관하는 입주작가 관련 프로그램, 기획전시 및 예술프로젝트 진행과정에서 발생하는 작품 및 작품재료를 일시적으로 보관하여 사업 진행에 효율적인 공간 활용도를 촉진한다.